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疾病进程或组织损伤修复都是一个动态过程，干细胞疗法的目的就是帮助机体对抗疾病或修复损伤组织。因此，在疾病的进展中，或在机体本身对抗损伤的过程中，及时补充干细胞更有利于疾病治疗或损伤修复。

损伤或病变的早期，损伤或病变区域微环境会比较恶劣，表现在缺血缺氧，氧化应激或炎症反应等多个方面。这时进行干细胞治疗可能不利于细胞的生存，影响治疗效果；而在损伤或病变的末期，自身修复已经基本结束，损伤修复动态平衡基本停止，坏死组织或液化吸收，或纤维变性，这时用干细胞治疗效果将不会很明显。

但是从“损伤-修复”的病理生理过程入手，我们可以对一些已经错过最佳治疗时机的患者，进行微小刺激，如针灸、电刺激等，或使用小剂量损伤性药物，再次人为造成局部的微小损伤，使损伤局部重新进入“损伤-修复”的动态过程（启动损伤修复机制），然后补充干细胞，将可能对失去最佳治疗时间的患者争取到新的机会，促进损伤组织的重新修复。