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对免疫损伤型卵巢的修复作用。自身免疫异常是核型正常的卵巢早衰患者的重要病因之一。 统计表明，大约20％的卵巢早衰是由于免疫系统不能识别自身卵巢组织所致，部分卵巢早衰患者血液中存在抗卵巢抗体，此类患者多伴有自身免疫性疾病，这类自身免疫性疾病常发生在卵巢早衰之前。有研究人员通过苏木精伊红染色法、细胞凋亡等方法分析干细胞对损伤卵巢的修复作用，发现干细胞可以顺利到达免疫损伤的卵巢组织；提示干细胞移植能显著促进免疫损伤卵巢结构的修复；干细胞移植通过大量分泌细胞因子等机制，显著减少免疫损伤卵巢颗粒细胞的凋亡。



对化学损伤型卵巢的修复作用。干细胞不但对免疫损伤型卵巢早衰具有一定的修复作用，对化学损伤的卵巢早衰也具有一定程度的修复作用.。研究发现移植干细胞组较对照组卵巢功能恢复更快，同时各级生长的卵泡数量也明显多于对照组。注入卵巢的干细胞主要分布在卵巢间质区，少量分布在卵巢泡膜细胞区；即干细胞可以改善卵巢内分泌功能，并长时间存在于卵巢组织，一方面可能是干细胞分泌的细胞因子抑制了卵巢细胞的凋亡，并促进分泌类固醇激素细胞，另一方面可能是部分干细胞分化为卵巢细胞，替代受损细胞并促进组织修复。综上所述，干细胞不仅对人为建立的卵巢早衰有修复作用，还能修复环境毒素对卵巢的损伤。



研究发现干细胞可一定程度修复环磷酰胺损伤的卵巢组织，甚至改善卵巢的内分泌功能。 干细胞能抑制环磷酰胺氮芥诱导的卵巢颗粒细胞的凋亡，干细胞可能通过这一途径保护受损卵巢组织。另外，多项研究已证实，干细胞移植可恢复失去生殖能力的性腺功能，表明其可能分化为性激素生成细胞。



修复机制。干细胞有“归巢”属性，即通过原位、静脉或腹腔等途径移植后，可迁移定植于特定的损伤部位如卵巢，并能在卵巢内存活生长。 研究表明，移植干细胞后卵巢形态、大小及动情周期都得到一定程度的恢复，病理组织切片上可以观察到卵巢各级卵泡数明显增加，颗粒细胞生长，抗颗粒细胞凋亡，内分泌功能得到改善，甚至恢复受孕等。